MFK Ružomberok stavia do veľkej miery svoju filozofiu na výchove vlastných odchovancov pre potreby A mužstva. Klub, v ktorom futbalovo vyrastali známi hráči, ako napríklad Dušan Švento alebo Erik Jendrišek, má momentálne okrem seniorského A mužstva 11 mládežníckych tímov a aj dievčenský mládežnícky tím žiačok a ženské družstvo.

Futbalové začiatky zažívajú hráči v tíme U8, kde sú tréningy zamerané na rozvoj herných činností jednotlivca a hráči si z času na čas zmerajú svoje schopnosti s rovesníkmi z iných klubov v priateľských zápasoch, prípadne turnajoch. Prípravky U9, U10 a U11 hrajú ligu prípraviek. Tieto zápasy sa od ročníka 2013/14, podobne ako stretnutia mladších žiakov, hrajú súbežne na dvoch poloviciach ihriska, pričom po stretnutí sa zrátajú výsledky „oboch“ súbojov. Tento model bol prijatý preto, aby mohli chlapci odohrať čo najviac minút. Okrem svojich zápolení, majú najmladšie nádeje nášho klubu možnosť ukázať sa aj počas zápasov Fortuna ligy, kedy pravidelne privádzajú na trávnik svojich kolegov z A mužstva a neraz majú možnosť odohrať modelovaný zápas cez prestávku ligového stretnutia, čo je pre budúcich futbalistov určite veľký zážitok a aj motivácia. Veď kto by netúžil raz skórovať v najvyššej súťaži a radostne bežať pred plný fanúšikovský kotol?

Medzi ďalšie tímy patria žiacke kategórie U12 a U13, ktoré hrajú 1. ligu stred, rovnako ako aj ich starší kolegovia z U14 a U15. Ružomberok má aj tri dorastenecké tímy U16, U17 a U19. Výbery U17 a U19 sa v roku 2002 prebojovali do najvyššej súťaže a po ročníku 2012/13 sa k nim pridal aj tím U16. Po sezóne 2014/15 sa dorastenci museli na rok rozlúčiť s prvou ligou, no v ďalšom ročníku si svoju účasť medzi elitou zaslúžene vybojovali naspäť.